Yavuz Sultan Selim'in Mısır Seferi sonucunda kutsal topraklar Osmanlı hakimiyetine girmiştir. 6 Temmuz 1517'de Kutsal Emanetler (Emanet-i Mukaddese) olarak bilinen ve aralarında Muhammed Peygamber'in hırkası, dişi, sancağı ve kılıcının da bulunduğu eşyalar, Hicaz'dan Yavuz Sultan Selim'e gönderilmiştir. Böylece, 29 Ağustos 1516'da Halifelik Abbasi soyundan Osmanlı soyuna geçmiştir.

Yavuz Sultan Selim, Yeniçeri Ocağı'nın ıslahı için bazı tedbirler almıştır. Buna göre, bundan böyle Yeniçeri Ağası saray tarafından, Ocak Erkân-ı Harbiyesi ise saltanat makamınca tayin edilecektir. Bu suretle, yüksek kumanda heyetini daha sıkı bağlarla saltanat makamına bağlamıştır.

İstanbul'un fethinden beri esaslı bir tersane yapılmamıştı. Bizans İmparatorluğu zamanından kalma, bir kadırga tersanesi ve Haliç'te küçük bir tersane vardı, ancak kadırga tersanesi bakımsızlıktan kullanılamayacak durumdaydı ve Haliç'teki tersane ise ihtiyacı karşılayamayacak kadar küçüktü.

Osmanlı Donanması'nı geliştirmek isteyen Yavuz Sultan Selim, Ağustos 1518'de Edirne'ye gitmeden önce, İstanbul'da Frenklerin tersanesine eş bir tersane yapılmasını emretmiştir. Donanmanın geliştirilmesi için hazırlıklar da aynı zamanda devam etmiştir. Her biri 700 tonluk 150 gemi için Arap kürekçiler getirilmiştir. Memlüklerin Kızıldeniz donanmasının komutanı olan Selman Reis İstanbul'a çağrılmıştır. Kısa zamanda İstanbul ve Gelibolu tersanelerinde 250 gemilik bir donanma hazırlanmıştır. Rodos Sen Jan Şövalyelerinin reisi bu hazırlıkların Rodos'a yönelik olmasından korkarak savunma önlemlerini arttırmıştır. Ancak bu donanmayı bir sefer için kullanmaya Sultan Selim'in ömrü yetmemiştir.

Yavuz Sultan Selim, dedesi Fatih Sultan Mehmet zamanında kullanılan Haliç Tersanesi'nin kapasitesini arttırmıştır. Konya'da Mevlevi Tekkesine su getirtmiştir. Medreselerin yanı sıra, sosyal ve ticari alanda hizmet verecek birçok bina inşa ettirmiştir. Hayatı yoğun savaşlarla geçen Yavuz Sultan Selim, Diyarbakır Fatih Paşa ve Elbistan Ulu Camii'ni inşa ettirmiştir. Ayrıca Şam Salihiye'de Muhyiddin İbn Arabi'ye camii ve imaret inşa ettirmiş, ayrıca Muhyiddin İbn Arabi'nin türbesini de bulup yaptırmıştır. I. Selim, 1516'da Şam'a Şam Sultan Selim Camii'ni yaptırmıştır. Ayrıca Mısır Seferi sırasında Hint ve Çin haritalarını da yaptıran Selim'e, Piri Reis tarafından 1513 yılında tamamlanan harita 1517 yılında Mısır'da Piri Reis'in kendisi tarafından sunulmuştur. Temelini attırdığı İstanbul Sultan Selim Camii'ni bitirmeye ömrü yetmemiş; bu eser oğlu I. Süleyman tarafından tamamlanmıştır. Sultan Selim bunlara ek olarak 1514 yılında İstanbul'da Yavuz Sultan Selim Cüzzamhanesi'ni yaptırmıştır.